管理科学与工程学院团总支，是在学院党总支领导和学校团委指导下对全院团员青年和团学组织开展教育、管理和服务的一级团组织，负责学院共青团的组织建设、团员青年思想教育、课外科研创新、社会实践、志愿服务、校园文化建设和学生成长成才服务，指导学院学生会、学生社团等学生组织，以及2个研究生和20个本科生共22个基层团支部的建设和活动开展等工作。

团总支设组织部、新闻中心、学术实践部、青年志愿者协会四个部门，学院团总支委员会由团总支书记、副书记组成，团总支各部门根据实际情况设部长、副部长若干。

学院团总支结合共青团组织青年、引导青年、服务青年、维护青少年权益的四项基本职能，和学校、学院关于团学工作围绕并服务于校院中心工作的要求，认真履行职责，积极开展活动，帮助和服务学生成长成才于全面发展。